Prof. Dr. Ayten KANDİLCİ
Moleküler Biyoloji ve Genetik

Ayten KANDİLCİ
Telefon
(262) 605 25 25
E-Posta
akandilcigtu.edu.tr
Ofis
C2 Blok, 228
Çalışma alanları
DEK proteinin normal ve kanseröz hücre biyolojisindeki rolünün incelenmesi.

1. Irfan Baki Kilic, Acelya Yasar, Irem Yalim Camci, Turkan Guzel, Aysegul Karahasan, Tamer Yagci, Naci Cine, Ayten Kandilci. NETosis Induced by Serum of Patients with COVID-19 is Reduced with Reparixin or Antibodies Against DEK and IL-8. Turk J Immunol 2023;11(3):X-X DOI:10.4274/tji.galenos.2024.74745

2.Emrah Özçelik, Ahmet Kalaycı, Büşra Çelik, Açelya Avcı, Hasan Akyol, İrfan Baki Kılıç, Türkan Güzel, Metin Çetin, Merve Tuzlakoğlu Öztürk, Zihni Onur Çalışkaner, Melike Tombaz, Dilan Yoleri, Özlen Konu, Ayten Kandilci. Doxorubicin induces prolonged DNA damage signal in cells overexpressing DEK isoform-2. PLoS One. 2022 Oct 3;17(10):e0275476. doi: 10.1371/journal.pone.0275476. eCollection 2022.

3. Çalışkaner ZO, Abdul Waheed A, Tuzlakoğlu Öztürk M, Oymak Y, Tazebay UH, Akar N, Kandilci A, Torun Özkan D. Identification of novel TUBB1 variants in patients with macrothrombocytopenia.Turk J Med Sci. 2021 Apr 30;51(2):490-500. doi: 10.3906/sag-2003-259.

4. Çakar T and Kandilci A. "Analysis of the effect of DEK overexpression on the survival and proliferation of bone marrow stromal cells". Turkish Journal of Biochemistry (2019), Volume 44, Issue 4, Page510-516.

5. Fukuda Y,Wang Y, Lian S, Lynch J, Nagai S, Fanshawe B, Kandilci A, Janke LJ, Neale G, Fan Y, Sorrentino BP, Roussel MF, Grosveld G, Schuetz JD. Upregulated heme biosynthesis, an exploitable vulnerability in MYCN-driven leukemogenesis. JCI Insight. 2017;2(15):e92409.

6.Çalışkaner ZO, Çakar T, Özçelik E, Özdilek A, Kim AS, Doğan Ö, Bosompem A, Grosveld G, Saka B, Kandilci A.DEK protein level is a biomarker of CD138positive normal and malignant plasma cells. PLoS One. 2017 May 30;12(5):e0178025. doi: 10.1371/journal.pone.0178025. eCollection 2017.

7.Kandilci A. Cancer Stem Cells: Lessons Learned from the Leukemic Stem Cells. Turk J Biol, (2016) 40; 1012-1017 © TÜBİTAK doi:10.3906/biy-1509-53.

8. Numata M, Yener MD, Ekmekçi SS, Aydın M, Grosveld G, Cardone M, Terranova S, Geltink RK, Özbek U, Özçelik E, Güleç Ç, Anak S,Karaman S, Öztürk G, Akbıyık M, Kandilci A. High MN1 expression increases the in vitro clonogenic activity of primary mouse B-cells. Leuk Res. 2015 Aug;39(8):906-12

9. Kandilci A, Özbek U: Application of transgenic technologies in mammalian development. ATLAS OF DYSMORPHOLOGY AND DIAGNOSIS (Chapter 17) (March 2015), Editor: Prof. Dr. Munis Dundar.

10. Kandilci A, Surtel J, Janke L, Neale G, Terranova S, Grosveld GC. Mapping of MN1 sequences necessary for myeloid transformation. PloS one 2013 Apr 23;8(4):e61706.

11. Sirma Ekmekci S, Ekmekci CG, Kandilci A, Gulec C, Akbıyık M, Emrence Z, Abacı N, Karakas Z, Agaoglu L, Unuvar A, Anak S, Devecioglu O, Ustek D, Grosveld G, Ozbek U. SET oncogene is upregulated in pediatric acute lymphoblastic leukemia. Tumori, 98: 252-256, 2012

12. Kandilci A and Grosveld G. Reintroduction of CEBPA in MN1-overexpressing hematopoietic cells prevents their hyper proliferation and restores myeloid differentiation. Blood. 2009 Aug 20;114(8):1596-606.

13. Kawagoe H, Kandilci A, Kranenburg T, Grosveld G. Overexpression of N-Myc rapidly causes AML in mice. Cancer Res. 2007 Nov 15;67(22):10677-10685.

14. Özbek U*, Kandilci A*, van Baal S, Bonten J, and Grosveld G. SET-CAN, the Product of the t(9;9) in Acute Undifferentiated Leukemia, Causes Expansion of Early Hematopoietic Progenitors and Hyperproliferation of Stomach Mucosa in Transgenic Mice. Am J Pathol. 2007 Aug;171(2):654-66.

15. Chan AO, Soliman AS, Zhang Q, Rashid A, Bedeir A, Houlihan PS, Mokhtar N, Al-Masri N, Ozbek U, Yaghan R, Kandilci A, Omar S, Kapran Y, Dizdaroglu F, Bondy ML, Amos CI, Issa JP, Levin B, Hamilton SR. Differing DNA methylation patterns and gene mutation frequencies in colorectal carcinomas from Middle Eastern countries. Clin Cancer Res. 2005 Dec 1;11(23):8281-7.

16. Kandilci A and Grosveld G. SET-induced calcium signaling and MAPK/ERK pathway activation mediate dendritic cell-like differentiation of U937 cells. Leukemia. 2005 Aug;19(8):1439-45.

17. Cardone M, Kandilci A, Carella C, Nilsson JA, Brennan JA, Sirma S, Ozbek U, Boyd K, Cleveland JL, Grosveld GC. The novel ETS factor TEL2 cooperates with Myc in B-lymphomagenesis. Mol Cell Biol. 2005 Mar;25(6):2395-405.

18. Kandilci A, Mientjes E, Grosveld G. Effects of SET and SET-CAN on the differentiation of the human promonocytic cell line U937. Leukemia. 2004 Feb;18(2):337-40.

19. N. Sarper, U. Ozbek, L. Agaoglu, U. Ozgen, O. Devecioglu, A. Kandilci, S.Sirma, Z. Karakas, N. Yalman, S. Anak, G. Gedikoglu. Clinical outcome of children with ALL1-AF4 positive acute lymphoblastic leukemia. HAEMA (AIMA), The Journal of the Helenic Society of Haematology. Haema 2000; 3(2):102-106.

20. Sarper N, Ozbek U, Agaoglu L, Özgen U, Kandilci A, Sırma S, Anak S, Yalman N, Eryılmaz E, Devecioglu O, Gedikoglu G. Detection of BCR/ABL Transcripts By Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction in Pediatric Acute Lymphoblastic Leukemia: Incidence and Clinical Features. Turk J Haematol. 2000;17 (4):197-206.

21. Cetinkale O, Bilgic L, Ayan F, Kandilci A. Neutrophil-mediated injury in ischemic skin flaps: amelioration of ischemic injury by cyclosporine in the rat. Ann Plast Surg. 1996 Jul;37(1):66-74.

Poster /Bildiri (2014-2022):
1. Camci, IY ; Kilic, IB ; Cakar, T ; Avci, A ; Karahasan, A ; Cine, N ; Yagci, T ; Kandilci, A. DEK level was reduced in the serum of patients with COVID-19. Europen Journal of Immunology (AUG 2021); Volume51, Page183-183, Supplement1, Meeting AbstractP-0246.

2.Zihni Onur ÇALIŞKANER*, Didem TORUN ÖZKAN, Merve TUZLAKOĞLU ÖZTÜRK, Nejat AKAR, Yeşim OYMAK, Uygar Halis TAZEBA1, Ayten KANDİLCİ. "TUBB1 p.T274M/R307H GENETİK VARYASYONUNUN MİKROTÜBÜL ORGANİZASYONU ÜZERİNDEKİ ETKİSİ". 43. Ulusal Hematoloji Kongresi. 1-4 Kasım 2017, Antalya.
*Genç Araştırmacı ödülü
Deneysel Hematoloji Ödülü

3. Ozkan D, Waheed A. A, Kandilci A, Akar N. FIRST OBSERVATION OF TUBB1
GENE MUTATIONS IN TURKISH PATIENTS WITH MACROTHROMBOCYTOPENIA. 21st
Congress of the European-Hematology-Association Location: Copenhagen,
DENMARK Date: JUN 09-12, 2016. HAEMATOLOGICA Volume: 101 Supplement: 1
Pages: 589-590 Meeting Abstract: E1423 Published: JUN 2016.

4. Ozkan DT, Waheed A. A, Kandilci A, Akar N. NOVEL TUBB1 GENE MUTATIONS IN
TURKISH PATIENTS WITH MACROTHROMBOCYTOPENIA. 36th World Congress of the
International-Society-of-Hematology Location: British Soc Haematol,
Glasgow, SCOTLAND Date: APR 18-21, 2016. BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY
Volume: 173 Special Issue: SI Supplement: 1 Pages: 36-36 Meeting
Abstract: 69 Published: APR 2016.

5. Çalışkaner ZO, Özçelik E, Kandilci A. Endojen DEK ifadesindeki Baskılanmanın Multiple Miyelom Hücre Hatlarının Temel Biyolojik Özellikleri Üzerindeki Etkileri.XIV. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, Fethiye, Muğla, 27-30 Ekim, 2015.

6. Özkan DT, Waheed AA, Kandilci A, Akar N. Makrotrombositopenili Ailede MYH9 ve TUBB1 Geninde İlk kez Saptanan Mutasyon Birlikteliği. 41. Ulusal Hematoloji Kongresi, Antalya, 21-24 Ekim, 2015 (Sözlü Bildiri). Klinik Laboratuvar Hematoloji Ödülü.

7. Fukuda Y, Wang Y, Nagai S, Fanshawe B, Kandilci A, Zindy F, Janke L, Neale G, Fan Y, Sorrentino B, Roussel M, Grosveld G, Schuetz J. The heme biosynthetic pathway plays a crucial role in N-myc myeloid leukemias. 44th Annual Scientific Meeting of the ISEH -International Society for Experimental Hematology- September 17-19, 2015. Kyoto, Japan. Experimental Hematology September 2015, Volume 43, Issue 9, Supplement, Page S63.

8. Yener MD, Numata M, Sırma Ekmekçi S, Aydın M, Grosveld G, Özbek U, Güleç Ç, Anak S, Karaman S,Öztürk G, Akbıyık M, Kandilci A. Pediatric TEL-AML1 positive acute lymphoblastic leukemia patients show increased MN1 expression. 20th Congress of EHA (European Hematology Association), Vienna, Austria, June 11-14, 2015. HAEMATOLOGICA Volume 100 (s1), Page:653. Published: JUNE 2015.

9. Çakar T, Özdilek A, Kim AS, Doğan Ö, Bosompem A, Saka B, Kandilci A. DEK EXPRESSION IN NORMAL AND MALIGNANT PLASMA CELLS. 19th Congress of EHA (European Hematology Association), Milan, Italy, June 12-15, 2014. HAEMATOLOGICA Volume 99, Supplement:1 Page:635 Published: JUNE 2014

10. Özdilek A, Çakar T, Doğan Ö, Saka B, Kandilci A. Multiple Miyelom Hastalarında DEK Ekspresyonunun Belirlenmesi. Deneysel Hematoloji Kongresi EBMT Highlight 2014. 18-20 Nisan 2014, Kapadokya, Nevşehir.

11. Fukada Y, Wang Y, Nagai S, Fanshawe B, Kandilci A, Sorrentino BP, Neale G, Fan YP, Grosveld, G, Schuetz, JD. OPTIMAL SURVIVAL OF N-MYC MYELOID LEUKEMIAS REQUIRE A PORPHYRIN EXPORTER. 10th International Meeting of the International-Society-for-the-Study-of-Xenobiotics (ISSX). Toronto, CANADA, SEP 29-OCT 03, 2013 DRUG METABOLISM REVIEWS Volume:45, S1: Page
21 Published: JAN 2014

Araştırma Projeleri:
2021-2023 (1001-Araştırma proje no SBAG-120S979): Dek Proteininin NETs Oluşumu ile İlişkisinin İncelenmesi. (Yürütücü)

2019-2021 (1001-Araştırma proje no KBAG-118Z765):DEK2 İzoformunun Ekspresyon Seviyesinin ve DNA Tamirindeki Fonksiyonunun İncelenmesi. (Yürütücü)

2015-2017 (3001-Başlangıç AR-GE proje no 214S601):Türk Popülasyonunda Makrotrombositopenili Bireylerde TUBB1 (Tübülin Beta 1) Gen Değişimleri İlişkisinin Genetik ve Fonksiyonel Olarak Araştırılması (Danışman).

2015-2016 (BAP-GTU proje no 2015-A14): DEK Ekspresyonu Modifiye Edilmiş RPMI-8226 Hücre Hattında CD138 Proteininin Analizi (Yürütücü).

2013-2015 (1001-Araştırma proje no TBAG-212T108): DEK Gen ifadesinin Multiple Miyelom Hücrelerine Etkisinin Araştırılması (Yürütücü).

2012-2013 (BAP-GYTE proje no 2012-A-04): Multiple miyeloma ve akut lösemi hastalarında DEK ve MN1 genlerinin prognostik önemi. (Yürütücü)

Doktora öğrencisi tezi kapsamında tamamlanan TÜBİTAK projeleri

2019-2020 TÜBİTAK 1002 (proje no 118Z664): Araştırmacı (Doktora öğrencisi Türkan Çakar; yürütücü)
2017-2018 TÜBİTAK 1002 (proje no 216Z006): Araştırmacı (Doktora öğrencisi Emrah Özçelik;yürütücü).

DOKTORA
1) DEK Gen İfadesinin Multiple Miyelom Hücrelerine Etkisinin Araştırılması. Zihni Onur Çalışkaner (2013 - 2018).

2) İnsan Kemik İliği Stroma Hücrelerindeki DEK Gen İfadesi Değişikliğinin Multiple Miyelom Hücrelerine Etkisinin Araştırılması. Türkan Çakar (2014 Eylül-2022 Eylül 2022).

3) DEK-2 İzoformunun Klonlanması ve Fonksiyonel Analizi. Emrah Özçelik (2015 Eylül-2023 Şubat).

4) Nötrofil Hücre Dışı Tuzaklarının Oluşumunda (NETosis) DEK Proteininin Rolününün Araştırılması. İrfan Baki Kılıç (2020- Devam ediyor).

5) Açelya Avcı (2022-Devam ediyor).

YÜKSEK LİSANS
1) Multiple Miyelom Hastalarında DEK proteininin Analizi. Ahmet Özdilek (Eylül 2011- Haziran 2013).

2) Multiple miyelom hastalarında DEK geninin kopya sayısı ve ekspresyon seviyesinin belirlenmesi. Türkan Çakar (Şubat 2012-Temmuz 2014)

3) Çocukluk çağı akut lenfoblastik lösemi hastalarında Meningioma 1 (MN1) gen ekspresyon seviyesinin araştırılması. M. Deniz Yener (Eylül 2011- Şubat 2018)

4) Multiple Miyelom Hücrelerinde Lentiviral Yöntemle DEK Geni İfadesinin Susturulması. Emrah Özçelik (Şubat 2013- Eylül 2015)

5) TUBB1 mutation analysis of macrothrombocytopenia patients in Turkey. Abdullah Abdul Waheed (Eylül 2013- Temmuz 2016)

6) İnsan Stroma ve Monosit Hücre Hatlarında DEK1 ve DEK2 İzoformlarının Salgılanmasının Belirlenmesi. Büşra Çelik (2021)

7) Analysis of the Localization of DEK Isoform-2. Hasan Akyol (2022).

8) DEK3 İzoformunun Fonksiyonel Analizi. Açelya Avcı (2022).

9) Aşırı DEK2 İzoformu İfadesinin HS27A Hücre Biyolojisine Etkilerinin Araştırılması. Ahmet Kalaycı (2022).

  • Doktora: Moleküler Biyoloji ve Genetik, Erasmus Üniversitesi, Hollanda/ St. Jude Children's Research Hospital, Genetik Bölümü, Memphis, TN, Amerika Birleşik Devletleri.
  • Yüksek lisans: Tıbbi Genetik, İstanbul Tıp Fakültesi, Çocuk Sağlığı Enstitüsü, Tıbbi Genetik Anabilim Dalı.
  • Lisans: Tıbbi Biyoloji, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyolojik Bilimler Bölümü.
Postdoc:
2006-2010: St. Jude Children's Research Hospital, Genetik Bölümü, Memphis, TN, Amerika Birleşik Devletleri.

2005-2006: Dana Farber Cancer Institute, Boston MA,Amerika Birleşik Devletleri.

Size daha iyi hizmet verebilmek için sitemizde çerezlere yer veriyoruz. Çerezlerle ilgili detaylı bilgi için çerez politikamıza göz atabilirsiniz. Detaylı bilgi için tıklayınız. Kabul ediyorum