Enstitü Yönetim Kurulu; Müdürün başkanlığında, müdür yardımcıları, müdürce gösterilecek altı aday arasından Enstitü Kurulu tarafından üç yıl için seçilecek üç öğretim üyesinden oluşur. 

Enstitü yönetim kurulunun görev ve yetkileri: 2547 Sayılı Yükseköğretim Kanunu ve Akademik Teşkilat Yönetmeliği’nde belirtildiği üzere;

• Enstitü kurulunun kararları ile tespit ettiği esasların uygulanmasında Müdüre yardım etmek,
• Enstitünün eğitim - öğretim, plan ve programları ile takvimin uygulanmasını sağlamak,
• Müdürün Enstitü yönetimi ile ilgili getireceği bütün işlerde karar almak,
• Öğrencilerin kabulü, ders intibakları ve çıkarılmaları ile eğitim - öğretim ve sınavlara ait işlemleri hakkında karar vermek,
• Bu kanunla verilen diğer görevleri yapmaktır.