gtu_logo

Moleküler Genetik

Laboratuvar İsmi

 Moleküler Genetik

Laboratuvar Sorumlusu

Yrd. Doç. Dr. F. İnci Özdemir

İlgili Bölüm

Moleküler Biyoloji ve Genetik

Telefon

0 262 605 2535

Adres

Gebze Teknik Üniversitesi
Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü C-2 Blok No: 118
41400 Çayırova, Kocaeli

Laboratuvar Çalışanları

Zişan Asal (Doktora Öğr. )
Tuba Korkmaz (Master Öğr.)
Ahmet Tülek (Master Öğr.)
Bahadır Aydın (Master Öğr.)
Enis Güney (Master Öğr.)
Oğuzhan Kavrık (Master Öğr.) 

Genel Bilgi

ATP bağımlı proteazlar hücrede birçok farklı aktivite ile ilişkili olan "AAA+ Protein Ailesi" (ATPases Associated with Diverse Cellular Activities) grubundandır.  Bu proteazlar (26S proteozom, Lon, HslVU (ClpYQ), FtsH, ClpAP/ClpXP) hem ökaryotlarda hem de prokaryotlarda bulunmaktadır. ATP-bağımlı bu enzimler, hücrede normal olmayan hasarlı proteinlerin ve kısa-ömürlü düzenleyici proteinlerin yıkımını gerçekleştiren ve bu özellikleriyle sinyal trandüksiyonu, hücre döngüsü ve transkripsiyon gibi pek çok hücresel süreçte söz sahibi olan enzimlerdir. ATP-bağımlı proteazlar yapısal ve fonksiyonal olarak korunmuş olmalarına rağmen biyolojik görevleri bakteriler arasında çeşitlilik göstermektedir. Özellikle termofilik organizmalardan üretilen bu enzimler yüksek sıcaklıklarda aktif ve kararlı oldukları için ilgi çekicidir. Bu sebeple laboratuvarımızda termofilik bakteri tarafından üretilen ATP bağımlı proteazlar ve bu enzimlerin klonlanması, saflaştırılması, biyokimyasal karakterizasyonu ve mutasyon çalışmaları gerçekleşmektedir.

Yapılan Uygulamalar

1. Geobacillus kaustophilus’a ait ATP-bağımlı Lon, HslVU, Ftsh gibi proteazların E. coli’ de klonlanması,
2. Rekombinat proteazların E. coli’ den saflaştırılması,
3. Saflaştırılan proteazların proteolitik ve ATPaz aktivitelerinin belirlenmesi ve biyokimyasal karakterizasyonları,
4. Lon ve FtsH proteaz genlerinin biyofilm oluşumunda ve hücre içindeki diğer etkilerini öğrenmek amacı ile gen delesyon çalışmaları.

Cihazların listesi

1. İnkübatör / Wisecube / Kore
2. Santrifüj / Beckman Coulter / Amerika
3. Steril kabin / Tez-San / Türkiye
4. PCR / Applied Biosystems / Amerika
5. Elektroforez sistemi / Bio-rad /Amerika
6. Vorteks / VWR/ Amerika
7. Manyetik Karıştırıcı / Heidolph / Almanya