Laboratuvar İsmi

 Mikrobiyal Genetik ve Biyoteknoloji Laboratuvarı

Laboratuvar Sorumlusu

 Doç. Dr. Sedef Tunca Gedik

İlgili Bölüm

Moleküler Biyoloji ve Genetik 

Telefon

 +90 262 605 2509/2535

Adres

Laboratuvar Çalışanları

Genel Bilgi

Mikroorganizmalar, yiyecek ve içecek sektörü, medikal ve tarım alanları dahil olmak üzere hemen her alanda kullanılmaktadırlar. Örneğin, bir çok mikrop, endüstriyel fermentasyondan (süt ürünleri, alkol, sirke vb. üretimi), birincil (amino asitler vb.) ve ikincil metabolitlerin (antibiyotikler, antikanser ilaçları, immün baskılayıcılar, biyoinsektisidler vb.) üretiminden ve ayrıca biyopolimerlerin (doku mühendisliği ve ilaç dağılımı için kullanılan) biyosentezinden sorumludurlar. Araştırmalarımız yeni mikrobiyal metabolitlerin (birincil ve ikincil) bulunması ve bilinen yararlı biyoaktif metabolitlerin biyosentezlerinin metabolizma mühendisliği veya yolak spesifik represör/aktivatörlerin izolasyonu ile arttırılması üzerine yoğunlaşmıştır. Hücre içerisinde farklı metabolizmalarla (örnek: fosfat metabolizması) ikincil metabolit biyosentezi arasındaki ilişkilerin aydınlatılmasına yönelik araştırmalar da sürdürülmektedir. GYTE’nin araştırma laboratuvarları süregelen projeleri destekleyecek alt yapıya sahiptir. Ayrıca, interdisipliner projelerin yürütülebilmesi için ilgili bölümler ile yakın iş birliği ilişkileri mevcuttur. 

Yapılan Uygulamalar

1. Genomik ve cDNA kütüphanelerinin hazırlanması.
2. Biyoaktif metabolit üretimi üzerindeki etkilerini görmek amacıyla hücre içinde bazı spesifik genlerin aşırı ifadeleri.
3. Biyoaktif metabolit üretimi ve bazı spesifik genler arasındaki ilişkiyi göstermek için knockout bakteri modellerinin oluşturulması.
4. DNA-protein etkileşimlerini çalışmak için EMSA (Electrophoretic Mobility Shift Assay) yönteminin uygulanması.
5. Protein-protein etkileşimlerini çalışmak için Yeast Two Hybrid-Three Hybrid sistemlerinin kullanılması.
6. Konvansiyonel ve moleküler mutasyon tekniklerinin kullanılması.
7. Southern, Northern, Western Blot tekniklerinin kullanılması.
8. Transkripsiyonel analiz.

Cihazların listesi