* Kirazlı, S., Tunca, S. (2022), Nisin and Gilaburu (Viburnum opulus L.) combination is a cost-effective way to control foodborne pathogen Staphylococcus aureus. Food Control

* Çınar, B., Demir, Z., Tunca, S. (2021), Heterologous expression of 8-demethyl-tetracenomycin (8-DMTC) affected Streptomyces coelicolor life cycle. Brazilian J Microbiol, 52, 1107–1118. https://doi.org/10.1007/s42770-021-00499-y

* Barkad, M.A., Bayraktar, A., Doruk, T., Tunca, S. (2021), Effect of lon protease overexpression on endotoxin production and stress resistance in Bacillus thuringiensis.Current Microbiology, 78, 3483–3493. 

* Demir Oksuz, Z., Doruk, T., Yagci, N., Tunca, S. (2021), Polyhydroxyalkanoate accumulation in Streptomyces coelicolor affected by SCO7613 gene region.Turk J Biol, 45, 275-286.

* Girgin Ersoy, Z., Kayıhan, C., Tunca, S. (2020), Higher nisin yield is reached with glutathione and pyruvate compared with heme in Lactococcus lactis N8. Brazilian Journal of Microbiology, DOI:10.1007/s42770-019-00216-w.

* Demir, Z., Bayraktar, A., Tunca, S. (2019), One extra copy of lon gene cause a dramatic increase in actinorhodin production by Streptomyces coelicolor A3(2). Current Microbiology, 76 (3) DOI:10.1007/s00284-019-01719

* Girgin Ersoy, Z., Turkay, O., Cinar, B., Gedik, S.T., Dimoglo, A. (2019), Comparative evaluation of disinfection mechanism of sodium hypochlorite, chlorine dioxide and electroactivated water. LWT-Food Science and Technology, 102, 205-213.

* Yesilirmak, F., Doruk, T., Yilmaz, S., Gedik, S.T. (2018), Comparative proteomic analysis of Bacillus thuringiensis wild-type and two mutant strains disturbed in polyphosphate homeostasis. Turk J Biol, 42, 87-102.

* Doruk, T., Girgin Ersoy, Z., Oncel, S., Gedik, S.T. (2016), High levels of polyphosphate kinase not only affects endotoxin production but also acid tolerance of Bacillus thuringiensis. Turk. J. Biol., 40, 1168-1177. doi:10.3906/biy-1512-38.

* Doruk, T., Gedik, S.T. (2013), An Efficient Gene Deletion System for Bacillus thuringiensis. Biologia, Section of Cellular and Molecular Biology, 68:3, 358-364.

* Doruk, T., Avican, U., Camcı, I.Y., Gedik, S.T. (2013), Overexpression of polyphosphate kinase (ppk) gene effects bioinsecticide production by Bacillus thuringiensis subsp. israelensis. Microbiological Research 168:4, 199-203.

* Camcı, I.Y., Doruk, T., Avican, U., Gedik, S.T. (2012), Deletion of polyphosphate kinase gene (ppk) had a stimulatory effect on actinorhodin production by Streptomyces coelicolor A3(2), Turk. J. Biol., 36,
373-380.

* Tunca S., Barreiro C., Coque J.J., Martin J.F. (2009), Two overlapping antiparallel genes encoding the iron regulator Dmdr1 and Adm proteins control sidephore and antibiotic biosynthesis and sporulation in
Streptomyces coelicolor, FEBS J., Vol 276, 4814-4827.

* Tunca S., Barreiro C., Coque J.J., Sola-Landa, A., Martin J.F. (2007), Transcriptional analysis of the iron regulation and desferrioxamine gene cluster of Streptomyces coelicolor A3(2), FEBS J., Vol 274 (4),
1110-1122.

* Mendes, M.V., Tunca, S., Antón, N., Recio, E., Aparicio, J.F. ve Martín, J.F. (2007). The two-component phoR-phoP system of Streptomyces natalensis: Inactivation or deletion of phoP reduces the negative phosphate regulation of pimaricin biosynthesis, Metab. Eng., Vol 9 (2), 217-227.

* Enriquez, L., Mendes, M., Anton, N., Tunca, S., Guerra, S., Martin, J.F. ve Aparicio, J.F. (2006). Efficient gene transfer system for the pimaricin producer Streptomyces natalensis, FEMS Microbiol. Letters, Vol. 257 (2), 312-318.

* Tunca, S., Yılmaz, E.I., Piret, J., Liras, P. ve Özcengiz, G. (2004). Cloning, characterization and heterologous expression of the aspartokinase and aspartate semialdehyde dehydrogenase genes of
Cephamycin C-producing Streptomyces clavuligerus, Res. Microbiol., Vol. 155 (7), 525-534.

* Gürsel, M., Tunca, S., Özkan, M., Özcengiz, G. ve Alaeddinoğlu, N.G. (1999). Immunoadjuvant Action of Plasmid DNA in Liposomes, Vaccine, Vol. 17, 1376-1383.

Conference Proceedings

1. Gürsel, M., Tunca, S., Özkan, M., Özcengiz, G., Alaeddinoğlu, N.G., Immunoadjuvant Action of Plasmid DNA in Liposomes. The First World Congress on Vaccines and Immunization. Marmara Istanbul, Türkiye. Poster Özetleri Kitabı, W2-5. 26-30 Nisan, 1998.
2. Tunca, S. , Piret, J., Özcengiz, G., Genetic manipulation of aspartate pathway for overproduction of cephamycin C by Streptomyces clavuligerus. 10th European Congress on Biotechnology, Madrid, İspanya. Poster Özetleri Kitabı, MIC 71. 7-12 Temmuz, 2001
3. Dede, F., Bilecen, K., Tunca, S., Sayers, Z., Functional studies of metallothionein gene of Triticum durum at molecular level. 30th FEBS Congress - 9th IUBMB Conference, Budapeste, Macaristan. FEBS Journal 272 (s1), G2-033P. 2-7 Temmuz, 2005.
4. Kaplan, B., Tunca, S., Sayers, Z., Expression of A. thaliana G protein alpha subunit in P. pastoris. 30th FEBS Congress - 9th IUBMB Conference, Budapeste, Macaristan. FEBS Journal 272 (s1), N1-025P. 2-7 Temmuz, 2005.
5. Yağcıoğlu, Ç., Tunca, S., Özcengiz, G., Cloning, characterization and heterologous expression of mesodiaminopimelic acid decarboxylase (lysA) gene from Streptomyces clavuligerus. 2nd FEMS Congress of European Microbiologists, Madrid, İspanya. Poster Özetleri Kitabı, P.GEN.58. 4-8 Temmuz, 2006.
6. Taşkın, B., Tunca, S., Özcengiz, G., Effect of homologous multiple copies of ask gene on cephamycin C biosynthesis in Streptomyces clavuligerus, FEBS JOURNAL 273: 325-326, Suppl. 1, JUN 2006.
7. Tunca, S. Barreiro, C., Coque, J.J.R., Martin, J.F., Transcriptional analysis of the iron regulation and desferrioxamine gene cluster of Streptomyces coelicolor A3(2). 10th International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms, Prag, Çek Cumhuriyeti. Poster Özetleri Kitabı, P 200. 24-28 Haziran, 2006.
8. Doruk, T., Savaş, Ü., Yalım, İ., Tunca, S., Relationship of polyP metabolism and bioinsecticide biosynthesis in Bacillus thuringiensis, 35. FEBS Congress Göteborg/İSVEÇ. FEBS Journal 277 (s1), B1-09. 26 Haziran – 01 Temmuz, 2010.
9. Yalım, İ., Doruk, T., Savaş, Ü., Tunca, S., The Effect of Polyphosphate Kinase Deficiency on Antibiotic Production in Streptomyces coelicolor, 35. FEBS Congress Göteborg/İSVEÇ. FEBS Journal 277 (s1), B1-13. 26 Haziran – 01 Temmuz, 2010.
10. Doruk, T., Girgin, Z., Tunca, S., An efficient gene deletion system for the bioinsecticide producer Bacillus thuringiensis, European Biotechnology Congress, 28 Eylül-01 Ekim, 2011.
11. Doruk, T., Tunca, S., A mutant strain of Bacillus thuringiensis which overproduce polyphophate kinase gene (ppk) shows high toxicity against Culex pipiens, Third International Entomopathogens and Microbial Control Symposium (EMC), 18-22 Eylül, 2011.

12. Demir Z., Doruk T., Gedik S.T., Relation between poly-β-hydroxybutyrate synthase gene (phaC) and antibiotic biosynthesis in Streptomyces coelicolor. 15th European Conference on Biotechnology, Istanbul-TURKEY23-26 September 2012.

13. Doruk T., Demir Z., Gedik S.T., Polyphosphate protects Bacillus thrungiensis cells against reduced internal pH. 15th European Conference on Biotechnology, Istanbul-TURKEY 23-26 September 2012.

14. Demir Öksüz, Z., Gedik, S.T., SCO7613 Affects Antibiotic Production in Streptomyces coelicolor, XVII. International Symposium on the Biology of Actinomycetes (ISBA), 8-12 October, 2014.

15. Yesilirmak, F., Doruk, T., Gedik, S.T., Endotoksin biosynthesis and polyphosphate metabolism in Bacillus thuringiensis, International Conference on Biopesticides 7 (ICOB), 19-25 October, 2014.

16. Avican, U., Demir Öksüz, Z., Gedik, S.T., The effects of multiple copies of polyphosphate kinase and exopolyphosphatase genes on antibiotic production by Streptomyces coelicolor, XVII. International Symposium on the Biology of Actinomycetes (ISBA), 8-12 October, 2014.

17. 17. Girgin Ersoy, Z., Gedik, S.T., Effect of overexpression of Bacillus catalase on Lactococcus lactis nisin production, 41. FEBS Congress Kuşadası/Turkey, 3-8 September, 2016. P-09.04.4-100/ 408

18. Karakurt, H.U., Gedik, S.T., Çakır, T., Genome scale comparison of perturbations in the nitrogen and phosphate metabolism of Streptomyces coelicolor by integrating transcriptome data with a curated metabolic network, 41. FEBS Congress Kuşadası/Turkey, 3-8 September, 2016. P-03.01.1-018/143

19. Girgin Ersoy, Z., Demir, Ğ., Cesur, M.F., Gedik, S.T., Comparison of different nisin quantification methods and optimization of nisin production by Lactococcus lactis, 41. FEBS Congress Kuşadası/Turkey, 3-8 September, 2016. P-02.02.2-050/221

20. Yılmaz, H., Cesur, M.F., Demir Öksüz, Z., Doruk, T., Gedik, S.T., Heterologous expression of Streptomyces coelicolor A3(2) “relA” and “lon” genes in different Escherichia coli mutants, XVIII.International Symposium on the Biology of Actinomycetes (ISBA), 22-27 May, 2017.

21. Zeynep Girgin Ersoy, Z., Turkay, O., Barisci, S., Cilek, A., Gedik, S.T., Inactivation Mechanisms of Escherichia coli and Enterococcus faecalis by Ozone, International Conference on Civil and Environmental Engineering (ICOCEE) Nevsehir, TURKEY May 8–10 2017.

22. Zeynep Girgin Ersoy, Z., Turkay, O., Barisci, S., Çınar, B., Gedik, S.T., Inactivation mechanisms of Enterococcus faecalis by sodium hypochloride, chlorine dioxide and electro activated water, FEMS 2017.

23. Demir Öksüz, Z., Gedik, S.T., Relation between Lon protease enzyme and antibiotic production in Streptomyces coelicolor, 3^rd International Conference on Engineering and Natural Science (ICENS) Budapest, Hungary May 3-7 2017.

24. Bayraktar, A., Demir, Ğ., Demir Öksüz, Z., Gedik, S.T., The effect of one extra copy of lon protease gene on Streptomyces coelicolor, International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences, Ankara, Turkey, 26-27 April 2018.

25. Demir, Ğ., Bayraktar, A., Demir Öksüz, Z., Doruk, T., Gedik, S.T., Comparison of antibiotic production profile of Streptomyces coelicolor M145 ∆ppk and Streptomyces coelicolor A3(2) ∆ppk, International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences, Ankara, Turkey, 26-27 April 2018.

    26.Bayraktar, A., Demir, Z., Yılmaz, H., Demir, Ğ., Tunca, S.,Molecular mechanisms
    affecting secondary metabolite production in Streptomyces coelicolor, Eurasian Congress on Molecular Biotechnology, O23 (Sözlü Sunum), Trabzon, Turkey, 19-21 April 2019.

    27. Girgin Ersoy, Z., Tunca, S., Antioxidant molecules enhance nisin production of Lactococcus lactis. Eurasian Congress on Molecular Biotechnology, P31, Trabzon, Turkey,
    19-21 April 2019.

26. 28. Abdi Barkad, M., Bayraktar, A., Tunca, S., Effect of lon protease overexpression in Bacillus thuringiensis, World Microbe Forum, 20-24 June 2021.

    29. Bayraktar, A., Demir, Z., Tunca, S., Morphological changes in Streptomyces coelicolor overexpressing lon protease gene, World Microbe Forum, 20-24 June 2021.

    30. Bayraktar, A., Tunca, S., Lon protease and secondary metabolite production in Streptomyces coelicolor, World Microbe Forum, 20-24 June 2021.

    31. Cinar, B., Demir, Z., Tunca, S., Morphological Changes in 8-DMTC Expressing Streptomyces coelicolor, World Microbe Forum, 20-24 June 2021.

PROJELER

1. Genetic manipulation of aspartate pathway for overproduction of cephamycin C by Streptomyces clavuligerus, ODTÜ Araştırma Fonu Projesi, AFP-07-02-00-25, Araştırmacı, 2000.

2. Beta-laktam antibiyotik üreticisi Streptomyces clavuligerus’da aspartik asit metabolik yolunun genetik manipülasyonu, TÜBİTAK Projesi, TBAG-2176, Araştırmacı, 2002.

3. Sefamisin C ve klavulinik asit üreticisi Streptomyces clavuligerus’un aspartokinaz, aspartat semialdehit dehidrogenaz ve mezo-diaminopimelat dekarboksilaz genlerinin klonlanması, manipülasyonu ve homolog gen ifadelerinin antibiyotik biyosentezine etkileri, DPT Projesi, DPT-2002K120540, Araştırmacı, 2002.

4. Rekombinant E. coli hücreleri tarafından üretilen Streptomyces clavuligerus aspartokinaz
ve aspartat semialdehid dehidrojenaz enzimlerinin saflaştırılması, kinetik özellikleri ve regülasyonu, ODTÜ Araştırma Fonu Projesi, BAP-2003-01-08-02, Araştırmacı, 2003.

5. Sefamisin C üreticisi S. clavuligerus'un homoserin dehidrogenaz geninin klonlanması enzimin karakterizasyonu ve gen blokasyonunun antibiyotik üretimine etkisinin incelenmesi, TÜBİTAK Projesi, SBAG-2753, Araştırmacı, 2004.

6. Streptomyces coelicolor polifosfat kinaz geninin (ppk) antibiyotik biyosentezine etkisi, GYTE Bilimsel Araştırma Projesi, BAP-2007-A-12, Yürütücü, 2007.

7. Bacillus thuringiensis’in biyoinsektisid (endotoksin) üretme kapasitesinin arttırılması amacıyla fosfat metabolizmasının değiştirilmesi, TÜBİTAK Projesi, TBAG-107T812, Yürütücü, 2008.

8. Fosfat metabolizması değiştirilmiş mutant Streptomyces coelicolor suşlarının farklı stres faktörlerine toleransı, GYTE Bilimsel Araştırma Projesi, BAP-2010-A-17, Yürütücü, 2010.

9. Polifosfat kinaz (ppk) geninden yoksun Bacillus thuringiensis mutant suşunda endotoksin biyosentezi, TÜBİTAK Projesi, TBAG-111T047, Yürütücü, 2011.

10. Ekzopolifosfataz (ppx) geninden yoksun Bacillus thuringiensis subsp. israelensis suşunda endotoksin biyosentezi, GYTE Bilimsel Araştırma Projesi, BAP-2011-A-09, Yürütücü, 2011.

11. Streptomyces coelicolor’da poli-3hidroksibutirat (PHB) yoksunluğunun antibiyotik üretimine etkisi,
GYTE Bilimsel Araştırma Projesi, BAP-2012-A-01, Yürütücü, 2012.

12. Lactococcus lactis fhuR geninin nisin üretimine etkisi, GYTE Bilimsel Araştırma Projesi, BAP-2013-A-09, Yürütücü, 2013.

13. Fosfat metabolizması değiştirilmiş iki Bacillus thuringiensis suşunun proteomik analizi, TÜBİTAK
Projesi, KBAG-113Z898, Yürütücü, 2014.

14. Lactococcus lactis rpiA geninin çoklu kopyalarının nisin biyosentezine etkisi, GYTE Bilimsel Araştırma Projesi, BAP-2014-A-10, Yürütücü, 2014.

15. Streptomyces coelicolor’da Lon Proteaz’ın antibiyotik üretimine etkisi, GTÜ Bilimsel Araştırma Projesi, 2018-A-102-16, Yürütücü, 2018-2019.

16. Streptomyces coelicolor’da yüksek antibiyotik üretiminin Lon proteaz’la ilişkisi, TÜBİTAK Projesi,
KBAG-118Z754, Yürütücü, 2019-2021.

17. Homolog expression of cholesterol oxidase gene in polyphosphate deficient Streptomyces coelicolor. GTÜ Bilimsel Araştırma Projesi, BAP-2019-A101-07, Yürütücü, 2019-2020.

18- Buğdayda bor toksisitesine karşı biyolojik bir ajan olarak Piriformospora indica’nın kullanım potansiyelinin ve fizyolojik etkilerinin araştırılması. TÜBİTAK Projesi, KBAG-118Z984, Araştırmacı,
2019-2022.

19- TunRS iki bileşenli sistemin Streptomyces clavuligerus’ta tunikamisin biyosentezi üzerindeki düzenleyici etkisinin araştırılması. TÜBİTAK Projesi, KBAG-121Z821, Araştırmacı, 2019-2022.

National Proceedings

1. Tunca, S., Piret, J., Özcengiz, G., Cefamicin C üreticisi Streptomyces clavuligerus’un aspartokinaz ve aspartat semialdehid dehidrogenaz genlerinin klonlanması ve gen ifadeleri. 12. Biyoteknoloji Kongresi, Ayvalık, Türkiye. Sözlü Bildiri. 17-21 Eylül, 2001.
2. Tunca, S., Özcengiz, G., Alaeddinoğlu, G., Bacillus subtilis ’in bir yerli izolatında a-amilaz yüksek üretimi için çalışmalar. 13. Biyoteknoloji Kongresi, Çanakkale, Türkiye. Poster Özetleri Kitabı, ENZP-ÇAR-14. 25-29 Ağustos, 2003.
3. Tunca, S., Özcengiz, G., Streptomyces clavuligerus’un aspartokinaz ve aspartat semialdehid dehidrogenaz genlerinin karakterizasyonu ve heterolog gen ifadeleri. 13. Biyoteknoloji Kongresi, Çanakkale, Türkiye. Sözlü Bildiri. 25-29 Ağustos, 2003.
4. Yılmaz, E.İ., Tunca, S., Özcengiz, G., Rekombinant E. coli hücreleri tarafından üretilen Streptomyces clavuligerus aspartokinaz ve aspartat semialdehid dehidrogenaz enzimlerinin saflaştırılması ve kinetik karakterizasyonları. 13. Biyoteknoloji Kongresi, Çanakkale, Türkiye. Sözlü Bildiri. 25-29 Ağustos, 2003.
5. Yağcıoğlu, Ç., Tunca, S., Özcengiz, G., Streptomyces clavuligerus’un mezo-diaminopimelik asit dekarboksilaz (lysA) geninin klonlanması ve karakterizasyonu. 13. Biyoteknoloji Kongresi, Çanakkale, Türkiye. Poster Özetleri Kitabı, ENDP-PER-19. 25-29 Ağustos, 2003.
6. Taşkın, B., Tunca, S., Özcengiz, G., Streptomyces clavuligerus aspartokinaz (ask) geninin çoklu kopyalarının sefamisin C üretici organizmada oluşturulması için yaklaşımlar. 14. Biyoteknoloji Kongresi, Eskişehir, Türkiye. Poster Özetleri Kitabı. 31 Ağustos-2 Eylül, 2005.
7. Doruk, T., Yılmaz, S., Yesilirmak, F., Gedik, S.T., Bacillus thuringiensis’te polifosfat metabolizması ve ikincil metabolit üretimi arasındaki ilişki. 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya, Türkiye. Bildiriler Kitabı, S-EB-8, 18-19 Aralık, 2015.
8. Yedekçi, A., Doruk, T., Gedik, S.T., Polifosfat sentezi ve yıkımından sorumlu enzimlerden yoksun Bacillus thuringiensis suşunda endotoksin biyosentezi. 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya, Türkiye. Poster Özetleri Kitabı, P-EB-29, 18-19 Aralık, 2015.
9. Girgin Ersoy, Z., Doruk, T., Gedik, S.T., Lactobacillus lactis’in nisin üretiminin optimizasyonu. 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya, Türkiye. Poster Özetleri Kitabı, P-GB-33, 18-19 Aralık, 2015
10. Doruk, T., Girgin Ersoy, Z., Gedik, S.T., Yüksek miktardaki polifosfat sadece endotoksin biyosentezini değil, Bacillus thuringiensis‘in asit direncini de arttırıyor. 18. Biyoteknoloji Kongresi, Konya, Türkiye. Bildiriler Kitabı, S-EB-12, 18-19 Aralık, 2015.
11. Yılmaz, H., Doruk, T., Gedik, S.T., Streptomyces coelicolor pütatif “lon” geninin E. coli de klonlanması, saflaştırılması ve karakterize edilmesi, GTÜ Lisansüstü Araştırmalar Sempozyumu 2017.
12. Cesur, M.F., Doruk, T., Gedik, S.T., Sınırlandırılmış cevaptan sorumlu relA geninin polifosfat üretemeyen Streptomyces coelicolor suşunda antibiyotik üretimine etkisi, GTÜ Lisansüstü Araştırmalar Sempozyumu 2017.
13. Yılmaz, H., Doruk, T., Gedik, S.T., Protein yıkımından sorumlu lon proteazın Streptomyces coelicolor’da antibiyotik üretimi üzerine etkisi, GTÜ Lisansüstü Araştırmalar Sempozyumu 2018.

Kişinin DersWeb siteleri

• MBG 272 Mikrobiyoloji
• MBG 274 Mikrobiyoloji Laboratuvarı
• MBG 621 Prokaryotik Gen Ekspresyonu
• MBG 672 Mikrobiyal İkincil Metabolitler

Yönetilen Yüksek Lisans Tezleri

1- 2002-2005 : Homolog recombination of ask and asd genes into chromosomal DNA of
Streptomyces clavuligerus. Bilgin Taşkın, M.Sc. Ortak tez danışmanı.

2- 2004-2006 : Cephamycin C production by Streptomyces clavuligerus mutants impaired in
regulation of aspartokinase. Araz Zeyniyev, M.Sc. Ortak tez danışmanı.

3- 2008-2010 : Polifosfat kinaz ve ekzopolifosfataz genlerinin çoklu kopyalarının Streptomyces coelicolor’ın ağır metal toleransına ve fosfat depolamasına etkisi. Ümmühan Savaş, M.Sc. Tez danışmanı.

4- 2008-2010 : Streptomyces coelicolor polifosfat kinaz geninin (ppk) antibiyotik biyosentezine etkisi. İrem Yalım, M.Sc. Tez danışmanı.

5- 2009-2012 : Streptomyces coelicolor’da poli-3hidroksibutirat (PHB) polimeri ve antibiyotik biyosentezi arasındaki ilişki. Zeynep Demir, M.Sc. Tez danışmanı.

6- 2010-2013 : Lactococcus lactis fhuR geninin çoklu kopyalarının nisin biyosentezine
etkisi. Zeynep Girgin, M.Sc. Ortak tez danışmanı.

7- 2010-2012 : Ekzopolifosfataz (ppx) geninden yoksun Bacillus thuringiensis subsp. israelensis suşunda endotoksin biyosentezi. Aybike Yedekçi, M.Sc. Tez danışmanı.

8- 2011-2013 : Bacillus thuringiensis ekzopolifosfataz genine ait (ppx) olası promotorun aktivitesinin lusiferaz haberci geni aracılığıyla ölçülmesi. Şerif Yılmaz, M.Sc. Tez danışmanı.

9- 2011-2013 : Bacillus thuringiensis polifosfat kinaz genine (ppk) ait olası promotorun transkripsiyonel aktivitesinin farklı koşullarda ölçülmesi. Ceyda Ketenci, M.Sc. Tez danışmanı.

10-2013-2016 : Streptomyces türleri tarafından üretilen, medikal ve biyoteknolojik öneme sahip metabolitlerin üretiminin genom ölçekli model yaklaşımı ile belirlenmesi. Hamza Karakurt, M.Sc. Tez danışmanı.

11- 2012-2016: Site-directed mutagenesis of metallo-beta-lactamase-like gene of Solibacter usitatus. Gözde Görgülü, M.Sc. Tez danışmanı (Prof. Dr. Yavuz Sezen ile birlikte).

12-2015-2017 : (p)ppGpp alarmonlarının sentezinden sorumlu relA geninin yüksek ifadesinin Streptomyces coelicolor’ın antibiyotik üretimine etkisi. Müberra Fatma Cesur, M.Sc. Tez danışmanı.

13- 2016-2018 : Polifosfat üretemeyen mutant Streptomyces coelicolor’da stres bağlantılı genler ile alarmon sentezinden sorumlu genlerin transkripsiyonel analizi. Ğarip Demir, M.Sc. Tez danışmanı.

14- 2016-2019 : Streptomyces coelicolor olası Lon proteaz geninin E. coli’de klonlanması,saflaştırılması ve karakterize edilmesi. Halil Yılmaz, M.Sc. Tez danışmanı.

15- 2017-2019 : Streptomyces coelicolor’da Lon proteazın, antibiyotik üretimi, sınırlandırılmış cevap ve polifosfat metabolizmaları üzerindeki etkisinin transkripsiyonel düzeyde belirlenmesi. Aslı Bayraktar,
M.Sc. Tez Danışmanı.

16- 2017-2019 : Heterolog expression of tetracenomisin gene cluster in polyphosphate deficient Streptomyces coelicolor strains. Buse Çınar, M.Sc. Tez Danışmanı.

17- 2019-20??: Tunahan Şengün, M.Sc. Tez Danışmanı.

18- 2020-20??: Adem Demiroğlu, M.Sc. Tez Danışmanı.

19- 2020-20??: Oytun Sarıgöz, M.Sc. Tez Danışmanı.

20- 2021-20??: Kevser Sanhueza, M.Sc. Tez Danışmanı

Yönetilen Doktora Tezleri

1- 2008-2013 : Bacillus thuringiensis subsp. israelensis’in biyoinsektisid (endotoksin) üretme kapasitesinin arttırılması amacıyla fosfat metabolizmasının değiştirilmesi. Tuğrul Doruk, Ph.D. Tez danışmanı.

2- 2013-2019 : Streptomyces coelicolor’da lon proteaz’ın “sınırlandırılmış cevap” ve “polifosfat” metabolizmalarıyla ilişkisi ve antibiyotik üretimine etkisi. Zeynep Demir, Ph.D. Tez danışmanı.

3- 2013-2020 : Lactococcus lactis’in oksidatif stres toleransının arttırılması ve aerobik koşullarda nisin üretimi ve optimizasyonu. Zeynep Girgin Ersoy, Ph.D. Tez danışmanı.

4- 2017-2021 : The effect of lon protease gene on the production of endotoxins in Bacillus thuringiensis. Mouktar Abdi Barkad, Ph.D. Tez danışmanı.

5-&#160;2013-20?? : Polifosfat üretemeyen&#160;</span>Streptomyces coelicolor&#160;suşu kullanılarak oksidatif stres,</span>
polifosfat ve demir metabolizmaları arasındaki moleküler ilişkilerin aydınlatılması.&#160;</span>Şerif Yılmaz, Ph.D. Tez danışmanı.</span>

6- 2017-20?? : Effects of natural antimicrobials on most abundant food pathogens and their use in food
preservation. Seda Kirazlı, Ph.D. Tez danışmanı.

7- 2019-20??: Nagihan Genel, Ph.D. Tez danışmanı.

8- 2019-20??: Halil Yılmaz, Ph.D. Tez danışmanı.

9- 2019-20??: Aslı Bayraktar Kavalcı, Ph.D. Tez danışmanı.

• Doktora: Biyoloji Bölümü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Orta Doğu Teknik Üniversitesi
• Yüksek lisans: Biyoloji Bölümü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Orta Doğu Teknik Üniversitesi
• Lisans: Biyoloji Bölümü, Orta Doğu Teknik Üniversitesi

* Doktora sonrası araştırmacı, Biyoloji Bölümü, ODTÜ ANKARA (2002-2003)

* Doktora sonrası araştırmacı, Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Sabancı Üniversitesi ISTANBUL (2003-2004)

* Doktora sonrası araştırmacı, Biyoteknoloji Enstitüsü (INBIOTEC), Leon Üniversitesi LEON-İSPANYA (2004-2006)