Hesaplamalı Kimya Laboratuvarı

Laboratuvar İsmi

Hesaplamalı Kimya Laboratuvarı 

Laboratuvar Sorumlusu

 Prof.DrAyşe Gül GÜREK

İlgili Bölüm

 Kimya

Adres

Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü, Fen Fakültesi, Kimya Bölümü,  P.K. 141  41400, Gebze/KOCAELİ

Laboratuvar Çalışanları

İsmail Dülger (Doktora Öğrencisi)
Ömer Faruk Emirik (Doktora Öğrencisi)

Genel Bilgi

   Amaç: Teorik kimya metotlarını kullanarak, kimya alanındaki problemleri çözmek.

Çıktılar:
1) Sensor, PDT sensitizörü, fotoiletken özellik gösteren moleküllerin teorik dizaynı
2) Oligomerlerin ve jellerin self-assembly davranışlarının ve morfolojilerinin aydınlatılması
3) Reaksiyon mekanizmlarının ortya çıkarılması
4) QSAR modellerinin üretilmesi.
Araştırma alanları:
- Ftalosiyanin moleküllerinin, uçucu organik bileşiklerle etkileşiminin kuantum kimyasal 
yöntemlerle aydınlatılması

- Hesaplamalı protein mühendisliği çalışmaları
- Oligomerik surfaktanların ve jelatör moleküllerinin self-assembly özelliklerinin Dissipative Particle Dynamic (DPD)

simülasyonları ile incelenmesi

-Ftalosiyanin moleküllerinin fotodinamik terapide sensitizör amaçlı moleküler dizaynları, katalizör ve sensör özellikler

inin bilgisayar destekli moleküler dizayn yöntemleriyle geliştirilmesi
-Organik ve fotokimyasal reaksiyon mekanizmalarının aydınlatılması
-Şiral kromatografik ayrışmaların moleküler modellemesi;
- QSAR, QSRR hesaplamaları

Yapılan Uygulamalar

Moleküler mekanik, yarı-deneysel ve kuantum mekanik hesaplamalar

QSAR, Moleküler doking, MD ve DPD simülasyonları

Cihazların listesi

 Sun Ultra40 model iş istasyonları

Kullanılan yazılımlar:

Gaussian, Amsterdam Density Functional (ADF), Dragon, AutoDock Vina, Gromacs

Üretilen Projeler

“Spektroskopik ve Kuantum Kimyasal Metotlarla Farklı Ftalosiyanin Moleküllerinin Uçucu Organik Bileşiklerle (UOB)

Etkileşiminin Aydınlatılması”. TÜBİTAK Projesi, Kasım 2009-Kasım 2011.
“Metalo-Ftalosiyaninlerin Kuvantum Kimyasal Yöntemlerle Fizikokimyasal ve Fotofiziksel Özelliklerinin Araştırılması

ve Kanserin Fotodinamik Terapisi İçin Yeni Metalo-Ftalosiyanin Türevlerinin Bilgisayar Destekli Dizaynı”. TÜBİTAK

Projesi, Eylül 2008.
“Demirli Ftalosiyanin Türevlerinin Aromatik Bileşiklerin Oksidasyonunda Katalizör Etkinliğinin Teorik Yöntemlerle Araştırılması”.

GYTE-BAP Projesi,2009.